除全自動進樣器機械、控制系統可能出現故障外，在操作及方法學方面也可能出現相應的問題，這里主要根據自動進樣器的設計特點，對試驗過程中可能出現的問題進行說明。

 

　　一、滯后體積

 

　　全自動進樣器中滯后體積是指流動相混合器到柱頭的體積，包括溶劑混合器和混合器到柱頭之間連接管的體積，對于低壓混合系統，也包括泵體積。滯后體積較大可能導致實驗的重復性差、方法移植困難。通常的HPLC系統中，滯后體積一般在0.2mL～5mL之間，主要取決于裝置的設計。

 

　　滯后體積中重要的部分為自動進樣器的定量環體積。只有定量環體積小于100μL時，其對滯后體積的影響才可以近似不計。當定量環體積較大時，這種影響將表現出來。例如，采用50μL的定量環時滯后體積為300μL，如果改用1mL定量環，滯后體積將變成1250μL，這種變化直接影響到色譜分離結果。在實際分離過程中，采用的色譜柱較細時，必須考慮滯后體積的影響，解決的辦法為更換較小的定量環，減小滯后體積。

 

　　二、樣品瓶過滿

 

　　如果樣品瓶過滿，在瓶蓋較緊、進樣量較大的情況下，可能會導致進樣重復性變差。其原因為樣品瓶中的樣品被抽出時，蓋緊的瓶蓋不能使空氣及時進入，造成部分真空。由于這種真空作用，注射器不能夠吸取足夠量的樣品體積。在的情況下，對于揮發性稀溶液樣品，針內甚至會出現氣泡，影響分析工作的正常進行。

 

　　有些全自動進樣器采用加排空針的方法克服這一問題，但這種方法并不常用。簡單的解決辦法為不要使樣品瓶過滿。一般裝樣量在樣品瓶的1／2到3／4之間較為適宜。

 

　　三、進針深度的調節

 

　　樣品量足夠多時，不必考慮這一問題。但對于痕量分析而言，進針深度的調節問題將較為突出。理想的情況下可以使進針深入到接近樣品瓶底部，這樣可以限度地利用樣品。當可用的樣品體積有*，可以采用微量樣品瓶以增加給定體積樣品的相對深度。如果進針過深，可能插入樣品瓶的底部，甚至導致針尖阻塞。如果進針深度不足，樣品只及針尖部分，針將不能抽取足夠量的樣品，部分空氣取而代之。

 

　　全自動進樣器的及時維護：

 

　　1.及時清洗色譜系統

 

　　平時分析好樣品，清洗好色譜柱后，用一根PEEK管連接在原先接色譜柱位置，用脫氣的純水以1.5mL/min流速清洗1.5小時，后用甲醇用同樣條件清洗。全自動進樣器清洗液換上甲醇，打開排液閥，用針筒抽吸越50mL，再關閉排液閥，purge，rinse各三次，結束后按shift，9，關閉全自動進樣器。

 

　　純水清洗色譜系統能清除管路中殘存的緩沖鹽，甲醇清洗，防止系統滋生細菌和微生物堵塞管路，也可以洗去不溶于水的物質。

 

　　2.及時更換計量泵密封墊圈

 

　　及時更換計量泵密封墊圈：更換這個位置的密封墊圈時要注意，與泵不同的是，使用者先要進入全自動進樣器的診斷維護界面，把計量泵內的柱塞桿收回去再拆卸計量泵，否則拆下來的時候柱塞桿處于受壓縮的位置，安裝的時候就麻煩了。計量泵的使用頻率非常的低，幾乎可以低到忽略不計，但是這個密封墊圈一樣會有磨損，使用三五年的儀器有時會發現這個位置漏液，但是這種問題發生的頻率非常低。